Encarnación, capital departamental, tiene una historia que se remonta a la época jesuítica, cuando la Reducción de Itapua, fundada en la otra margen del río Paraná, se traslado a la margen derecha. Todavía, sin embargo, tuvieron que transcurrir largos años hasta la fundación definitiva de la ciudad, que tuvo su primera etapa de florecimiento en la primera mitad del siglo XX. La segunda época de prosperidad se inicio en la década de 1970, con el inicio de la agricultura extensiva y mecanizada y el auge del comercio fronterizo.

Encarnación es hoy una ciudad de gran belleza paisajística, unida a la ciudad argentina de Posadas por el puente San Roque González, una obra maestra de la ingeniería tendida sobre el río Paraná. Un santuario, el de Itacua, es el centro de espiritualidad de la ciudad y si se debe citar una de las fiestas populares, talvez lo más acertado seria mencionar el carnaval, que alcanza en Encarnación nivele notables de colorido y animación.

Las Colonias Unidas están compuestas de tres comunidades - Hohenau, Obligado y Bella Vista - que fueron fundadas por inmigrantes brasileños y alemanes y han hecho de la agricultura, la industria yerbatera y la producción láctea un exitoso fenómeno de productividad y beneficio económico. Hoy estas tres ciudades no son solamente ejemplo de pujanza, sino desarrollan una rica actividad cultural y cuentan con toda la infraestructura necesaria para un buen despegue en el turismo.

Otras comunidades, como Capitán Miranda, Coronel Bogado y Carmen del Paraná también fundaron su prosperidad actual en la agricultura y tienen la característica común de contar con una población con alto porcentaje de descendientes de inmigrantes eslavos. Fram, con su magnifica basílica ortodoxa, una exquisita obra de arquitectura, es llamada capital del handbol y del trigo, además del titulo de ciudad saludable.

Un paisaje de silos es también el que caracteriza a otras ciudades itapuenses que se encuentran en la Ruta Tecnológica, y en el caso de La Paz y Pirapo se trata de colonias japonesas de sostenido desarrollo económico que han alcanzado un alto standard de vida. En el caso de General Artigas y San Pedro del Paraná, se trata de ciudades que fueron fundadas a finales del siglo XVIII en tierras del cacique Bobi Cango, y que han conservado tradiciones muy autenticas; San Pedro del Paraná fue una importante estación del ferrocarril y lugar de nacimiento del poeta, músico y político Epifanio Méndez Fleitas.

Reducción Jesus de tavarangueEl paso de los Jesuitas por el Departamento de Itapua dejó obras de notable valor histórico, arquitectónico y religioso en tres comunidades: Trinidad del Paraná, Jesús de Tavarangue y San Cosme y San Damián. Las dos primeras poseen valiosos conjuntos arquitectónicos que fueron declarados Patrimonio Universal dela Humanidad por UNESCO y que hoy son atractivos turísticos de primer orden que atraen a visitantes y estudiosos de todo el mundo. No menos impresionantes son las construcciones que se encuentran en pie en San Cosme y San Damián, a orillas del Río Paraná.

El desarrollo económico constante, que se extiende a lo largo de Itapua, trajo consigo la creación y evolución de nuevas ciudades, tales como Maria Auxiliadora (Tomas Romero Pereira), Capitán Meza, Mayor Otaño y Carlos Antonio López, que se encuentran en medio de escenarios de gran belleza paisajística.